نشانگر زیستی جدید به طور دقیق تهاجمی بودن سرطان را پیش بینی می‌کند

به گزارش مجله خبری نگار، محققان دریافتند که مقدار RNA پلیمراز II (RNAPII) که در ژن‌های هیستون (ژن‌های مسئول تولید پروتئین‌های ساختاری هیستون که نقش اساسی در تنظیم DNA داخل سلولی دارند) یافت می‌شود، با قدرت تومور و احتمال عود ارتباط دارد. سطوح بالای این آنزیم نشان دهنده گسترش بیش از حد سرطان است که می‌تواند به تغییرات کروموزومی کمک کند که منجر به ایجاد تومور‌ها می‌شود.

دکتر یی چنگ، نویسنده اصلی و استادیار بیوانفورماتیک و زیست شناسی محاسباتی در MD Anderson، توضیح می‌دهد: "نقش ژن‌های هیستون به عنوان یک عامل محدود کننده در میزان تکثیر سلولی و در نتیجه به عنوان یک پیش بینی کننده قوی تکثیر بیش از حد سلول‌های سرطانی نادیده گرفته شده است.

این مطالعه بر تکنیک CUTAC (بخش زیرکروماتین هدف قابل دسترس) که در آزمایشگاه دکتر استفان هنیکوف توسعه یافته است، متکی بود که اجازه می‌دهد بیان ژن با استفاده از نمونه‌های اثبات شده با فرمالین و پارافین غوطه ور (FFPE) که برای ذخیره طولانی مدت بافت استفاده می‌شود، به طور دقیق مورد مطالعه قرار گیرد.

تیم تحقیقاتی توضیح داد که CUTAC امکان تجزیه و تحلیل نمونه‌های بافتی ذخیره شده برای مدت طولانی را با استفاده از روش‌های نگهداری قدیمی‌تر مانند تثبیت فرمالین و غوطه وری پارافین فراهم می‌کند که به آن نمونه‌های FFPE (تثبیت فرمالین و غوطه وری پارافین) گفته می‌شود. این روش در حفظ بافت برای اهداف تحقیقاتی پزشکی رایج است، جایی که نمونه برای مدت طولانی حفظ می‌شود.

این فناوری جدید توالی‌های تکه تکه شده غیر کدگذاری شده را هدف قرار می‌دهد که در آن RNAPII متصل است و اجازه می‌دهد فعالیت رونویسی ژن مستقیما از DNA اندازه گیری شود.

آنالیز نمونه‌های مختلف سرطان نشان داد که بیان ژن‌های هیستون در تومور‌ها به طور معنی داری بیشتر از بافت نرمال بود.

برای آزمایش این فرضیه، محققان ۳۶ نمونه از بیماران مننژیوم را با استفاده از فناوری CUTAC تجزیه و تحلیل کردند و داده‌ها را با بیش از ۱,۳۰۰ نمونه بالینی موجود مقایسه کردند.

نتایج نشان داد که RNAPII می‌تواند به طور دقیق بین تومور‌ها و بافت طبیعی تمایز قائل شود و همچنین عود سریع تومور و از دست دادن کروموزومی بالقوه را پیش بینی کند.

این مطالعه همچنین نشان داد که همین تکنیک قادر به پیش بینی پرخاشگری سرطان پستان با تجزیه و تحلیل نمونه‌های FFPE از ۱۳ بیمار مبتلا به سرطان پستان تهاجمی است.

دکتر استفان هنیکوف، محقق موسسه پزشکی هوارد هیوز و یکی از نویسندگان این مطالعه، گفت: "تکنیکی که ما برای بررسی نمونه‌های تومور حفظ شده ایجاد کردیم، اکنون مکانیسم جدیدی از تهاجمی بودن سرطان را نشان می‌دهد. شناسایی این مکانیسم نشان می‌دهد که ممکن است به یک آزمایش جدید برای تشخیص و احتمالا درمان سرطان تبدیل شود.

محققان قصد دارند به آزمایش این تکنیک بر روی نمونه‌های FFPE از انواع مختلف سرطان ادامه دهند که می‌تواند منجر به بهبود استراتژی‌ها برای تشخیص زودهنگام و درمان هدفمند تومور‌های سرطانی شود.

نتایج این مطالعه در مجله Science منتشر شد.

منبع: مدیکال اکسپرس