بیش از ۳۰ گونه جدید باکتری در نمونه‌های بیماران یافت شد

به گزارش مجله خبری نگار، میکروب‌های ناشناخته در بیمارستان‌ها امری رایج هستند. محققان دانشگاه بازل سال‌های زیادی را صرف جمع‌آوری و تجزیه و تحلیل آنها کرده‌اند. آنها گونه‌های جدید باکتریایی متعددی را شناسایی کرده‌اند که برخی از آنها برای اقدامات بالینی مهم هستند. این مطالعه جدید در مجله BMC Microbiology منتشر شده است.

عفونت‌های باکتریایی در صورت مشخص بودن علت، می‌توانند به طور مؤثرتری درمان شوند. در بیشتر موارد، آزمایش‌های آزمایشگاهی برای شناسایی عامل بیماری‌زا کافی است. با این حال، گاهی اوقات روش‌های استاندارد کافی نیستند - به عنوان مثال، اگر گونه باکتریایی هنوز طبقه‌بندی نشده باشد یا رشد آن به ویژه دشوار باشد.

تیمی از دانشگاه بازل و بیمارستان دانشگاه بازل از سال ۲۰۱۴ مشغول جمع‌آوری و تجزیه و تحلیل نمونه‌های بیماران حاوی این میکروب‌های ناشناخته بوده‌اند. محققان بیش از ۳۰ گونه جدید باکتریایی را کشف کرده‌اند که برخی از آنها با عفونت‌های بالینی قابل توجه مرتبط هستند.

در مجموع، این تیم به سرپرستی دکتر دانیل گلدنبرگر، میکروبیولوژیست، ۶۱ پاتوژن باکتریایی ناشناخته موجود در نمونه‌های خون یا بافت بیماران مبتلا به طیف وسیعی از بیماری‌ها را تجزیه و تحلیل کردند.

روش‌های آزمایشگاهی مرسوم، مانند طیف‌سنجی جرمی یا تعیین توالی بخش کوچکی از ژنوم باکتری، برای همه این جدایه‌ها نتیجه‌ای نداشت. بنابراین، محققان با استفاده از روشی که تنها چند سال در دسترس بود، کل ماده ژنتیکی باکتری را تعیین توالی کردند. سپس توالی‌های ژنوم شناسایی شده را با استفاده از یک ابزار آنلاین با سویه‌های شناخته شده مقایسه کردند.

از ۶۱ باکتری مورد تجزیه و تحلیل، ۳۵ مورد قبلاً ناشناخته بودند. محققان ۲۶ سویه باقی‌مانده را به عنوان گونه‌های دشوار برای شناسایی طبقه‌بندی کردند: یا توالی ژنومی آنها اخیراً به پایگاه‌های داده اضافه شده است، یا توصیف طبقه‌بندی مناسبی از عوامل بیماری‌زا اخیراً ایجاد شده است.

ارزیابی داده‌های بیماران نشان داد که هفت مورد از ۳۵ سویه جدید از نظر بالینی قابل توجه بودند، به این معنی که می‌توانند باعث عفونت‌های باکتریایی در انسان شوند. گلدنبرگر خاطرنشان کرد: «چنین ارتباط مستقیمی بین گونه‌های باکتریایی تازه شناسایی شده و اهمیت بالینی آنها در گذشته به ندرت منتشر شده است.»

بیشتر گونه‌های تازه شناسایی‌شده متعلق به جنس‌های Corynebacterium و Schaalia هستند که هر دو از باسیل‌های گرم مثبت هستند. دکتر گلدنبرگر توضیح داد: «بسیاری از گونه‌های این دو جنس در میکروبیوم طبیعی پوست و غشا‌های مخاطی انسان یافت می‌شوند. به همین دلیل است که اغلب دست کم گرفته می‌شوند و به ندرت مورد مطالعه قرار می‌گیرند.» با این حال، آنها می‌توانند هنگام ورود به جریان خون - به عنوان مثال، به دلیل تومور - باعث عفونت شوند.

یک عامل بیماری‌زای دشوار برای شناسایی نیز ممکن است اهمیت بالینی داشته باشد. این عامل در انگشت شست ملتهب یک بیمار پس از گازگرفتگی سگ کشف شد. یک تیم تحقیقاتی کانادایی نیز اخیراً این باکتری را از زخم‌های ناشی از گازگرفتگی سگ یا گربه جدا کرده است.

دکتر گلدنبرگر گفت: «این موضوع ما را به این گمان انداخت که این یک عامل بیماری‌زای جدید است که باید آن را زیر نظر داشته باشیم.» در سال ۲۰۲۲، محققان کانادایی به درستی این باکتری را Vandammella Animalimorsus (گزش حیوانات Vandammella) نامیدند.

نامگذاری این گونه جدید، مورد بعدی در فهرست کار‌های تیم بازل است. آنها از نزدیک با پروفسور پیتر واندام از دانشگاه گنت، متخصص در طبقه‌بندی باکتری‌ها، همکاری می‌کنند. دو باکتری قبلاً نامگذاری شده‌اند. یکی از آنها، Pseudoclavibacter triregionum، به موقعیت بازل در نزدیکی مرز‌های سوئیس، فرانسه و آلمان اشاره دارد.

با این حال، پروژه‌ای که توسط تیم دانیل گلدنبرگر آغاز شده، هنوز به پایان نرسیده است. محققان همچنان به طور سیستماتیک عوامل بیماری‌زای ناشناخته یافت شده در نمونه‌های بیماران از بیمارستان دانشگاه بازل را جمع‌آوری و توالی‌یابی می‌کنند و تاکنون بیش از بیست گونه جدید را کشف کرده‌اند.

دکتر گلدنبرگر توضیح داد: «ما در اینجا متوجه یک پویایی مهم شده‌ایم: به لطف پیشرفت‌های تکنولوژیکی در باکتری‌شناسی، مطالب بسیار بیشتری در مورد گونه‌های باکتریایی تازه کشف‌شده منتشر می‌شود. این پیشرفت، تشخیص دقیق عفونت‌های ناشی از عوامل بیماری‌زای نادر و درمان مؤثر آنها را از همان ابتدا در آینده آسان‌تر خواهد کرد.»