آموزش عملی شبیه‌سازی داکینگ مولکولی

به گزارش مجله خبری نگار، این کارگاه ۲۷ و ۳۰ دی ماه ساعت ۹ الی ۱۲، با تدریس دکتر محمد مصطفی پورسیف و دکتر الناز مهدی‌زاده، در سالن کنفرانس دانشکده علوم نوین پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تبریز برگزار می‌شود.

داکینگ مولکولی یکی از ابزار‌های کلیدی در زیست‌شناسی مولکولی ساختاری و طراحی دارو است. هدف از داکینگ پروتئین ـ لیگاند، پیش‌بینی جایگاه اتصال مناسب لیگاند به پروتئینی با ساختار سه‌بعدی شناخته شده است. روش‌های موفقیت‌آمیز داکینگ فضا‌های با ابعاد بالا را به‌طور موثر بررسی می‌کند و از تابع امتیازدهی استفاده می‌کند تا به درستی کاندیدا‌های داکینگ را امتیازبندی کند.

داکینگ مولکولی کاربرد‌های وسیعی دارد، به‌طور مثال این روش می‌تواند برای غربالگری مجازی (virtual screening) کتابخانه (library)‌های بزرگ ترکیبات، امتیازدهی به نتایج، و پیشنهاد فرضیه‌های ساختاری در مورد چگونگی اتصال لیگاند (ligand) به مولکول هدف (target) که در بهینه‌سازی کاندیدا‌های دارویی بسیار ارزشمند است و همچنین مطالعات مکانیسم شیمیایی مورد استفاده قرار گیرد.