به گزارش مجله خبری نگار،به دلیل نقش مهمی که این پروتئینهای مضر در گسترش بیماری دارند، این پروتئینها یکی از اهداف اصلی واکسنها و درمانهای بیماری COVID-۱۹ هستند. اما زمانی که بخشهای خاصی از این پروتئینها جهش پیدا میکنند، این درمانها به تدریج کارایی خود را از دست میدهند.
اکنون، محققان در موسسه ACS Central Science گزارش دادهاند که مولکولهای کوچکی را کشف کردهاند که با موفقیت بخشهایی از این پروتئینهای مضر را که جهش کمتری دارند، هدف قرار میدهند.
پروتئینهای روی سطح ویروس کرونا، با حمله به سلول تغییر شکل میدهند. این پروتئینها در ساختار “باز” خود، بخشی به نام دامنه اتصال گیرنده (RBD) را در معرض دید قرار میدهند تا بتواند به پروتئین ACE۲ در سلولهای انسانی بچسبند. در ساختار “بسته” این پروتئین ها، بخش RBD در داخل پروتئین قرار میگیرد و نمیتواند به سلولهای انسانی متصل شود. آنتی بادیهای موجود در برخی درمانهای COVID-۱۹ یا تحریک شده توسط واکسنها یا عفونت، دامنه RBD را هدف قرار میدهند تا نتواند به ACE۲ متصل شود. با این حال، برخی از سویههای در حال ظهور ویروس کرونا، حاوی جهش در نقطهی RBD هستند. این بدان معناست که واکسنها و درمانهای آنتیبادی که برای هدف قرار دادن آن نقطه طراحی شدهاند، میتوانند با جهش این ویروس، مؤثرتر شوند.
برای غلبه بر این مشکل، میتوان به جای آن، بخشهای کمتر مستعد جهش پروتئین مضر ویروس کرونا را مورد هدف قرار داد. یک احتمال وجود یک حفره در این پروتئینها است که پاشنه آشیل ویروس نامیده شده است. هنگامی که این محل توسط اسیدهای چرب آزاد (FFAs) یا چند ترکیب دیگر اشغال میشود، پروتئین در پیکربندی بسته و بی ضرر خود قفل میشود. با این حال، این ترکیبات، درمانهای مناسبی نیستند، زیرا پایدار نیستند یا ضعیف به هم متصل میشوند. بنابراین، تعدادی محقق تصمیم گرفتند به دنبال درمانهای بالقوه دیگری باشند که فاقد این نقصها هستند.
این تیم با استفاده از مدلسازی رایانه ای، مجموعهای از مولکولهای کوچک را غربال کردند و به دنبال مولکولهایی بودند که بتوانند آنها در این حفره بریزند و محکم به پروتئین سطح ویروس بچسبند و آن را در حالت بسته خود نگه دارند. سپس محققان از تشدید پلاسمون سطحی و تکنیکهای دیگر برای ارزیابی آنالوگهای این مولکولها، برای بهبود اتصال و حلالیت استفاده کردند. به گفته این تیم، ترکیبات به دست آمده، که میتوانند به پروتئینهای ناشی از ویروس کرونا اصلی و همچنین سویه omicron BA.۴ متصل شوند، میتوانند به عنوان نقطه شروعی برای توسعه درمانهای طیف گسترده برای COVID-۱۹ عمل کنند.