به گزارش مجله خبری نگار، دانشمندان موسسه تحقیقات زیست پزشکی IRB بارسلونا یک پلتفرم محاسباتی به نام DiffInvex ایجاد کردهاند که قادر به شناسایی ژنهایی است که به سلولهای سرطانی کمک میکنند تا از شیمی درمانی فرار کنند. نتایج این مطالعه در مجله Nature Communications (NatCom) منتشر شده است.
این پلتفرم روی ۱۱۰۰۰ نمونه ژنومی از بافت سرطانی و سالم آموزش داده شد. الگوریتمها تقریباً ۳۰ نوع سلول مختلف را پوشش دادند. DiffInvex توانایی شناسایی دقیق جهشهایی را که در مقاومت دارویی نقش دارند و شناسایی ژنهای دخیل در ایجاد مقاومت درمانی را نشان داد. این ژنها شامل PIK۳CA، SMAD۴ و STK۱۱ بودند که محرکهای شناختهشده رشد تومور هستند.
روش DiffInvex مبتنی بر مقایسه نرخ جهش در نواحی کدکننده DNA با نواحی غیرکدکننده مجاور است. این رویکرد امکان ارزیابی دقیقتر تأثیر تنوع ژنتیکی را بدون نادیده گرفتن هرگونه جهش بالقوه فراهم میکند.
این تجزیه و تحلیل همچنین نشان داد که برخی جهشها، از جمله تغییرات در ژن ARID۱A، میتوانند در طول پیری طبیعی ایجاد شوند و همیشه با توسعه تومور مرتبط نیستند. این موضوع نقش آنها را به عنوان محرکهای واقعی سرطانزا زیر سوال میبرد و ممکن است بر استراتژیهای تشخیص زودهنگام تأثیر بگذارد.
به گفته دانشمندان، کشف مسیرهای «جهانی» در توسعه سرطان مقاوم میتواند توسعه ترکیبات دارویی دقیقتر را تسهیل کند. به عنوان مثال، ترکیب شیمیدرمانی سنتی با مهارکنندههای مسیرهای سیگنالینگ فعال شده توسط ژنهای PIK۳CA یا STK۱۱ میتواند عود بیماری را به تأخیر بیندازد.